Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NBPF8Q3BBV2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NBPF8Q3BBV2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NBPF8Q3BBV2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms