Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBF2

WSCD2, WSC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD2Q2TBF2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD2Q2TBF2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD2Q2TBF2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms