Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERCC6LQ2NKX8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms