Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC96Q2M329 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC96Q2M329 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms