Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC27Q2M243 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC27Q2M243 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC27Q2M243 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms