Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTL8BQ17RB0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTL8BQ17RB0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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