Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6V1FQ16864 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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