Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRNQ16849 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms