Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA3Q16787 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA3Q16787 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms