Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK4Q16654 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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