Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL23Q16540 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms