Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDB1Q16531 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
DDB1Q16531 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
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