Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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RPE65Q16518 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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RPE65Q16518 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPE65Q16518 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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