Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX1Q15475 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX1Q15475 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms