Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE3CQ15386 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE3CQ15386 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
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