Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RABEP1Q15276 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
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RABEP1Q15276 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
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RABEP1Q15276 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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RABEP1Q15276 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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RABEP1Q15276 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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RABEP1Q15276 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP1Q15276 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
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