Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRKQ15262 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRKQ15262 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
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