Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NECTIN1Q15223 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NECTIN1Q15223 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NECTIN1Q15223 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
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