Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCOLCEQ15113 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCOLCEQ15113 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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