Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCF4Q15080 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCF4Q15080 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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