Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFIXQ14938 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIXQ14938 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms