Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GINS1Q14691 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINS1Q14691 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms