Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMC1AQ14683 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC1AQ14683 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC1AQ14683 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms