Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN5AQ14524 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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