Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2H2Q13888 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2H2Q13888 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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