Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PTCH1Q13635 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTCH1Q13635 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
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