Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF4BQ13523 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF4BQ13523 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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