Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCIRG1Q13488 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCIRG1Q13488 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
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