Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL49Q13405 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL49Q13405 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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