Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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