Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF1Q13351 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF1Q13351 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF1Q13351 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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