Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PRDM2Q13029 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRDM2Q13029 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
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