Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 C11orf84-203ENST00000540893 554 ntTSL 37.93□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 SERGEF-204ENST00000525168 342 ntTSL 35.55□□□□□ -1.528e-7■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 WWOX-215ENST00000569332 1856 ntTSL 223.03■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 24.2
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ILF3Q12906 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.444e-9■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 ALG8-220ENST00000532552 645 ntTSL 59.62□□□□□ -0.874e-9■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 ALG8-218ENST00000532306 844 ntTSL 58.15□□□□□ -1.14e-9■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 ALG8-221ENST00000615266 1469 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.144e-9■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 ALG8-214ENST00000530608 714 ntTSL 37.09□□□□□ -1.274e-9■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 ALG8-209ENST00000526849 612 ntTSL 24.5□□□□□ -1.694e-9■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 ALG8-206ENST00000525783 493 ntTSL 34.4□□□□□ -1.714e-9■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 ASB16-AS1-204ENST00000592897 551 ntTSL 418.78■□□□□ 0.65e-8■■■■□ 24.2
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ILF3Q12906 ASB16-AS1-203ENST00000591166 754 ntTSL 38.37□□□□□ -1.075e-8■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.324e-8■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 ASB16-AS1-202ENST00000588785 574 ntTSL 36.67□□□□□ -1.345e-8■■■■□ 24.2
ILF3Q12906 ST7-215ENST00000438863 1005 ntTSL 526.6■■□□□ 1.856e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.76e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.646e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.646e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.646e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.916e-7■■■■□ 24.1
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ILF3Q12906 ST7-209ENST00000417919 577 ntTSL 44.96□□□□□ -1.626e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 ST7-OT4-205ENST00000471110 591 ntTSL 43.95□□□□□ -1.786e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 ST7-211ENST00000421345 531 ntTSL 43.11□□□□□ -1.916e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 LONP1-212ENST00000590728 591 ntTSL 423.88■■□□□ 1.412e-7■■■■□ 24.1
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ILF3Q12906 SEPT7-216ENST00000635172 509 ntTSL 222.02■■□□□ 1.122e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.092e-7■■■■□ 24.1
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ILF3Q12906 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 NSD2-227ENST00000515806 816 ntTSL 310.8□□□□□ -0.682e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 24.1
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ILF3Q12906 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.992e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 TYW1-202ENST00000361660 3255 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -12e-7■■■■□ 24.1
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ILF3Q12906 GPATCH8-203ENST00000586037 345 ntTSL 54.07□□□□□ -1.762e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 TM9SF3-203ENST00000464654 658 ntTSL 53.66□□□□□ -1.822e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 SEPT7-220ENST00000635669 569 ntTSL 43.31□□□□□ -1.882e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 SEPT7-213ENST00000634600 583 ntTSL 23.06□□□□□ -1.922e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-8■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 MLLT10-215ENST00000495130 744 ntTSL 312.34□□□□□ -0.433e-12■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 AGFG2-205ENST00000477022 1327 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.774e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.743e-7■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 RALGAPA1-208ENST00000554573 2358 ntTSL 52.61□□□□□ -1.991e-6■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 RALGAPA1-207ENST00000554355 490 ntTSL 22.06□□□□□ -2.081e-6■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 RALGAPA1-214ENST00000556837 394 ntTSL 31.92□□□□□ -2.11e-6■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.963e-6■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 24.1
ILF3Q12906 FANCA-206ENST00000561660 762 ntTSL 517.87■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 FANCA-201ENST00000305699 1430 ntTSL 215.58■□□□□ 0.087e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 FANCA-229ENST00000567988 915 ntTSL 512.15□□□□□ -0.467e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 FANCA-210ENST00000563318 605 ntTSL 512.15□□□□□ -0.467e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 FANCA-211ENST00000563510 633 ntTSL 510.72□□□□□ -0.697e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 RHEB-205ENST00000478470 1153 ntTSL 524.93■■□□□ 1.583e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.393e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.843e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 RHEB-203ENST00000470370 501 ntTSL 54.34□□□□□ -1.713e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.797e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 TMEM94-206ENST00000577380 554 ntTSL 424.71■■□□□ 1.557e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 TMEM94-224ENST00000582186 565 ntTSL 421.53■■□□□ 1.047e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 TMEM94-220ENST00000581519 545 ntTSL 420.79■□□□□ 0.927e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.577e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 PDHB-203ENST00000461692 1535 ntTSL 1 (best)18.54■□□□□ 0.567e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 SFSWAP-203ENST00000535236 5593 ntTSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 24
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