Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNMA1Q12791 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMA1Q12791 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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