Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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GTF3C1Q12789 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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GTF3C1Q12789 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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GTF3C1Q12789 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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GTF3C1Q12789 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C1Q12789 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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