Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXO1Q12778 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXO1Q12778 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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