Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 RKM4YDR257C 1485 nt5.06□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 YOL153CYOL153C 1746 nt5.06□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 TRF5YNL299W 1929 nt5.05□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 LEU1YGL009C 2340 nt5.05□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 RAI1YGL246C 1164 nt5.05□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 TDA5YLR426W 981 nt5.05□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 RPC19YNL113W 429 nt5.05□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 PBN1YCL052C 1251 nt5.05□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 YIL001WYIL001W 1542 nt5.05□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 CDC48YDL126C 2508 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 VID28YIL017C 2766 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 PRE9YGR135W 777 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 FAA4YMR246W 2085 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 SSB1YDL229W 1842 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 BUD8YLR353W 1812 nt5.04□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 EMP47YFL048C 1338 nt5.03□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 SSH1YBR283C 1473 nt5.03□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 SOL4YGR248W 768 nt5.03□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 YIL165CYIL165C 360 nt5.03□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt5.03□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 CBP3YPL215W 1008 nt5.03□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 SSO1YPL232W 873 nt5.03□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 YCF1YDR135C 4548 nt5.03□□□□□ -1.6
LSP1Q12230 VPS73YGL104C 1461 nt5.02□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 MPP10YJR002W 1782 nt5.02□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 SSA2YLL024C 1920 nt5.02□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 IMG2YCR071C 441 nt5.02□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 MRPL25YGR076C 474 nt5.02□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 MAD2YJL030W 591 nt5.02□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 SEC13YLR208W 894 nt5.02□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 CTR1YPR124W 1221 nt5.02□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 MMR1YLR190W 1476 nt5.01□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 GSM1YJL103C 1857 nt5.01□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 SPO77YLR341W 1434 nt5.01□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 SEN1YLR430W 6696 nt5.01□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 ASP1YDR321W 1146 nt5.01□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 NKP2YLR315W 462 nt5.01□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 YIF1YNL263C 945 nt5.01□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 YOL035CYOL035C 303 nt5.01□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 YPL077CYPL077C 723 nt5.01□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 TPA1YER049W 1935 nt5.01□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 RAM1YDL090C 1296 nt5□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 YLR407WYLR407W 687 nt5□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 HFA1YMR207C 6372 nt5□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 SUI1YNL244C 327 nt5□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 TGL4YKR089C 2733 nt4.99□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 OCA4YCR095C 1089 nt4.99□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 YML119WYML119W 1074 nt4.99□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 IMP2YMR035W 534 nt4.99□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 APE1YKL103C 1545 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 PMC1YGL006W 3522 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 YDL094CYDL094C 510 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 HST4YDR191W 1113 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 HSP31YDR533C 714 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 YHR214WYHR214W 612 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 YAR066WYAR066W 612 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 SEC72YLR292C 582 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 ADD37YMR184W 597 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 MDM12YOL009C 816 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 MCM4YPR019W 2802 nt4.98□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 NOP58YOR310C 1536 nt4.97□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 RPL24AYGL031C 468 nt4.97□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.97□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 YGP1YNL160W 1065 nt4.97□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 PWR1PWR1 941 nt4.97□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 MIS1YBR084W 2928 nt4.97□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 IZH3YLR023C 1632 nt4.97□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 MNN1YER001W 2289 nt4.97□□□□□ -1.61
LSP1Q12230 HER2YMR293C 1395 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 SEM1YDR363W-A 270 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 DBR1YKL149C 1218 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 LDB18YLL049W 540 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 YPL014WYPL014W 1146 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 SRB6YBR253W 366 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 ATR1YML116W 1629 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 PRM1YNL279W 1986 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 LAS1YKR063C 1509 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 KCC4YCL024W 3114 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 VAC7YNL054W 3498 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 CLD1YGR110W 1338 nt4.96□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 ATG32YIL146C 1590 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 JHD2YJR119C 2187 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 BCP1YDR361C 852 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 YHP1YDR451C 1062 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 AAD6YFL056C 639 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 SKI6YGR195W 741 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 MID2YLR332W 1131 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 YET2YMR040W 483 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 NHX1YDR456W 1902 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 ATM1YMR301C 2073 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 AVT1YJR001W 1809 nt4.95□□□□□ -1.62
LSP1Q12230 PRT1YOR361C 2292 nt4.94□□□□□ -1.62
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