Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	YAP1802	YGR241C	1707 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	SPR28	YDR218C	1272 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	KTR2	YKR061W	1278 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YKR104W	YKR104W	921 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	VPS73	YGL104C	1461 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	KEX1	YGL203C	2190 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	VHS3	YOR054C	2025 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YNL134C	YNL134C	1131 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YNL217W	YNL217W	981 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YPR174C	YPR174C	666 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	LCB2	YDR062W	1686 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	MIS1	YBR084W	2928 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	RNA15	YGL044C	891 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YRA2	YKL214C	612 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YAR030C	YAR030C	342 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	MAC1	YMR021C	1254 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	NOP13	YNL175C	1212 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	YOR200W	YOR200W	399 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	SLD2	YKL108W	1362 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	GAS4	YOL132W	1416 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	LDB17	YDL146W	1476 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VIK1	Q12045	GIP4	YAL031C	2283 nt		4.34	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	PIM1	YBL022C	3402 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	SAP4	YGL229C	2457 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	TAF12	YDR145W	1620 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	SNA2	YDR525W-A	240 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	BNA6	YFR047C	888 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	RRT7	YLL030C	342 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	SWC3	YAL011W	1878 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	FRE7	YOL152W	1863 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	NUG1	YER006W	1563 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	ARG82	YDR173C	1068 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	DON1	YDR273W	1098 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	CAB1	YDR531W	1104 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	RPL8A	YHL033C	771 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	MFM1	YPL060W	1242 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	NOC2	YOR206W	2133 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	MEF2	YJL102W	2460 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	YDR056C	YDR056C	618 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	SAE3	YHR079C-A	276 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	WSS1	YHR134W	810 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	LSO1	YJR005C-A	282 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	APS1	YLR170C	471 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	CUS2	YNL286W	858 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	ALG5	YPL227C	1005 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	SUA7	YPR086W	1038 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	PUT2	YHR037W	1728 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	MSC2	YDR205W	2175 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	OPT2	YPR194C	2634 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	RPG1	YBR079C	2895 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	TRF5	YNL299W	1929 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	SIR2	YDL042C	1689 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	SRO7	YPR032W	3102 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	CPR4	YCR069W	957 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	snR7-L	snR7-L	214 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	RPS11A	YDR025W	471 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	YGR066C	YGR066C	879 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	PRE9	YGR135W	777 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	MRM1	YOR201C	1239 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	YCF1	YDR135C	4548 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	TUB2	YFL037W	1374 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	SAT4	YCR008W	1812 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	IMD2	YHR216W	1572 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	AIF1	YNR074C	1137 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	YOL035C	YOL035C	303 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	MRE11	YMR224C	2079 nt		4.28	□□□□□ -1.72
VIK1	Q12045	ECM22	YLR228C	2445 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	BUD13	YGL174W	801 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YIR043C	YIR043C	693 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	RIA1	YNL163C	3333 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	FAR10	YLR238W	1437 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	ARG4	YHR018C	1392 nt		4.27	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	MCP2	YLR253W	1710 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	DRN1	YGR093W	1524 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	HCM1	YCR065W	1695 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	CDC14	YFR028C	1656 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	CBF5	YLR175W	1452 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	MMR1	YLR190W	1476 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	RAM1	YDL090C	1296 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	HSP42	YDR171W	1128 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	TYW3	YGL050W	822 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	COA3	YJL062W-A	258 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	PHA2	YNL316C	1005 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YPL114W	YPL114W	420 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	MTC1	YJL123C	1437 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	VMA1	YDL185W	3216 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YSH1	YLR277C	2340 nt		4.26	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	MCM2	YBL023C	2607 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	MTR10	YOR160W	2919 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YIL092W	YIL092W	1902 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	HOS3	YPL116W	2094 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	SNF2	YOR290C	5112 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	OSH2	YDL019C	3852 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	RPP1A	YDL081C	321 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	DBP3	YGL078C	1572 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	DAL3	YIR032C	588 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	NTR2	YKR022C	969 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	PAU17	YLL025W	375 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	MAP1	YLR244C	1164 nt		4.25	□□□□□ -1.73

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