Protein–RNA interactions for Protein: Q12035

FCF2, rRNA-processing protein FCF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FCF2Q12035 SPO19YPL130W 672 nt3.69□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 MET8YBR213W 825 nt3.69□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 YBR139WYBR139W 1527 nt3.69□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 HMG1YML075C 3165 nt3.69□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 ECM22YLR228C 2445 nt3.69□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 SWI3YJL176C 2478 nt3.68□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 GAL11YOL051W 3246 nt3.68□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 ARF2YDL137W 546 nt3.68□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 HSP42YDR171W 1128 nt3.68□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 YLR374CYLR374C 390 nt3.68□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 MTR10YOR160W 2919 nt3.68□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 DRN1YGR093W 1524 nt3.67□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 RSC3YDR303C 2658 nt3.67□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 KNH1YDL049C 807 nt3.67□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.67□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 APS1YLR170C 471 nt3.67□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 UMP1YBR173C 447 nt3.67□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 HIS4YCL030C 2400 nt3.67□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 VID28YIL017C 2766 nt3.67□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 GIP4YAL031C 2283 nt3.67□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 MET3YJR010W 1536 nt3.66□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 RPS11AYDR025W 471 nt3.66□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 NOP13YNL175C 1212 nt3.66□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 PWR1PWR1 941 nt3.66□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 SSH1YBR283C 1473 nt3.66□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 PTA1YAL043C 2358 nt3.66□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 MET12YPL023C 1974 nt3.65□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 TRK1YJL129C 3708 nt3.65□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 DBP3YGL078C 1572 nt3.65□□□□□ -1.82
FCF2Q12035 YER145C-AYER145C-A 438 nt3.65□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 ERP5YHR110W 639 nt3.65□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YIL165CYIL165C 360 nt3.65□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 AAD10YJR155W 867 nt3.65□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 NTR2YKR022C 969 nt3.65□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 POP3YNL282W 588 nt3.65□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.65□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 TPA1YER049W 1935 nt3.65□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 CDC14YFR028C 1656 nt3.65□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 LAS1YKR063C 1509 nt3.65□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 TUB2YFL037W 1374 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 SYF2YGR129W 648 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 MHO1YJR008W 1017 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YLR156WYLR156W 345 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YLR159WYLR159W 345 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YLR161WYLR161W 345 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 SHE1YBL031W 1017 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YMR130WYMR130W 909 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 RCL1YOL010W 1104 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 REX4YOL080C 870 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YPL191CYPL191C 1083 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 STP22YCL008C 1158 nt3.64□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 GAS4YOL132W 1416 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YDL012CYDL012C 324 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 LCP5YER127W 1074 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 COX4YGL187C 468 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 GVP36YIL041W 981 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 PEX22YAL055W 543 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YPR174CYPR174C 666 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 VMA1YDL185W 3216 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 VPS45YGL095C 1734 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YJR015WYJR015W 1533 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 SPT23YKL020C 3249 nt3.63□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 RDH54YBR073W 2877 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YDL172CYDL172C 480 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 RPL14AYKL006W 417 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YGP1YNL160W 1065 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YPL041CYPL041C 624 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 PRP9YDL030W 1593 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YCF1YDR135C 4548 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 KEX1YGL203C 2190 nt3.62□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YIL001WYIL001W 1542 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 JHD2YJR119C 2187 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 VPS29YHR012W 849 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YHR214WYHR214W 612 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 IRC9YJL142C 393 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YAR066WYAR066W 612 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 SIW14YNL032W 846 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 SUI1YNL244C 327 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 EFM2YBR271W 1260 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 SKM1YOL113W 1968 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 OAF1YAL051W 3144 nt3.61□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 MAG2YLR427W 2013 nt3.6□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 ADD66YKL206C 804 nt3.6□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 MRPL39YML009C 213 nt3.6□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 ROT1YMR200W 771 nt3.6□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 FSH3YOR280C 801 nt3.6□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 IDI1YPL117C 867 nt3.6□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 ATG14YBR128C 1035 nt3.6□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 BCK2YER167W 2556 nt3.6□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 RAM1YDL090C 1296 nt3.59□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 YGL088WYGL088W 366 nt3.59□□□□□ -1.83
FCF2Q12035 ARO2YGL148W 1131 nt3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms