Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL4Q0D2K0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPAL4Q0D2K0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms