Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PUDPQ08623 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms