Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC1Q08554 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC1Q08554 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms