Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4CQ08493 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4CQ08493 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms