Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F3Q08477 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP4F3Q08477 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4F3Q08477 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms