Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGAP1Q07960 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP1Q07960 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms