Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4BQ07343 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms