Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 YKL115CYKL115C 393 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 CDC123YLR215C 1083 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 TRI1YMR233W 681 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 IZH2YOL002C 954 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 TMA46YOR091W 1038 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 CYS4YGR155W 1524 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 MKC7YDR144C 1791 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 UBP9YER098W 2265 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 TCM62YBR044C 1719 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 MPA43YNL249C 1629 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 VCX1YDL128W 1236 nt6.57□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YDR415CYDR415C 1125 nt6.57□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 ATG36YJL185C 882 nt6.57□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 MDE1YJR024C 735 nt6.57□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 SDH3YKL141W 597 nt6.57□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 MAP1YLR244C 1164 nt6.57□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt6.57□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YPL205CYPL205C 345 nt6.57□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 HEM1YDR232W 1647 nt6.57□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 BDF2YDL070W 1917 nt6.56□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt6.56□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 TOS4YLR183C 1470 nt6.56□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YER084W-AYER084W-A 513 nt6.56□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 TYW3YGL050W 822 nt6.56□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 AIM33YML087C 939 nt6.56□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 CUE4YML101C 354 nt6.56□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt6.56□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 COQ1YBR003W 1422 nt6.56□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 RVB2YPL235W 1416 nt6.56□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 IME4YGL192W 1803 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 BUD8YLR353W 1812 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 PXL1YKR090W 2121 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YCR085WYCR085W 354 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 NSA2YER126C 786 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YPT1YFL038C 621 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 MMF1YIL051C 438 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 POR2YIL114C 846 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YJL007CYJL007C 315 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 SFC1YJR095W 969 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 SHE1YBL031W 1017 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 PEP4YPL154C 1218 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 FDH2YPL275W 711 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 BIO3YNR058W 1443 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 SPO23YBR250W 1572 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 ITT1YML068W 1395 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 EDE1YBL047C 4146 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 MPH3YJR160C 1809 nt6.55□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 SEC12YNR026C 1416 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YGL159WYGL159W 1113 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 SYN8YAL014C 768 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 MRP49YKL167C 414 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YKR032WYKR032W 315 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YMR010WYMR010W 1218 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YNL092WYNL092W 1203 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YNL203CYNL203C 612 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 ARF3YOR094W 552 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 MKK1YOR231W 1527 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 ARP3YJR065C 1350 nt6.54□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 PPH3YDR075W 927 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YDR157WYDR157W 402 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 HEM2YGL040C 1029 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 TYS1YGR185C 1185 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 CTF8YHR191C 402 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 THI11YJR156C 1023 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YNL324WYNL324W 396 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 AIM39YOL053W 1188 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 MIX23YBL107C 591 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 VMA4YOR332W 702 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 RUD3YOR216C 1455 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YHR202WYHR202W 1809 nt6.53□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 VPS38YLR360W 1320 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 NOP58YOR310C 1536 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 SRP101YDR292C 1866 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 CNN1YFR046C 1086 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 RPL24AYGL031C 468 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 SCM4YGR049W 564 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 YGR126WYGR126W 693 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 YJR141WYJR141W 1044 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 YKL077WYKL077W 1179 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 YAL069WYAL069W 315 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 YAR061WYAR061W 204 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 LDB7YBL006C 543 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 ECM30YLR436C 3825 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 CYC2YOR037W 1101 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 EMP65YER140W 1671 nt6.52□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 NUP1YOR098C 3231 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 YER133W-AYER133W-A 342 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 YGL204CYGL204C 306 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 OST5YGL226C-A 261 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 PUS6YGR169C 1215 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 PEX21YGR239C 867 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 CIC1YHR052W 1131 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 YNL046WYNL046W 519 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 MRPL17YNL252C 846 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 GRE1YPL223C 507 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 IBA57YJR122W 1494 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 EAR1YMR171C 1653 nt6.51□□□□□ -1.37
HDA3Q06623 MIX14YDR031W 366 nt6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26 ms