Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms