Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TFF2Q03403 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TFF2Q03403 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms