Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNB2Q03252 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms